水主作为核心角色，凭借其出色的治疗能力和毒素控制效果，成为许多玩家偏爱的选择。水主阵容的核心在于合理搭配输出、控制和辅助型忍者，形成均衡的战斗体系。理想的阵容构成应包括一个强力输出型忍者、一个具备控场能力的辅助型忍者以及一个高生命值的坦克型忍者。
水主的天赋选择对阵容强度影响显著，推荐携带水遁·水流鞭作为奥义技能，其封穴效果能有效限制敌方行动；普攻选择掌仙术可提供持续治疗；被动技能查克拉手术刀和神经毒素的组合能造成混乱控制，而淬毒则是叠毒流的核心被动，使队伍每次攻击都能附加中毒效果。
水毒牙阵容是当前较为强势的水主搭配方案，以天天少年篇和牙少年篇为核心输出。天天的高连段奥义配合牙的群体伤害技能，能在短时间内叠加多层中毒效果，造成可观的持续伤害。辅助位可选择红或静音，前者能通过镜反克制火主阵容，后者则提供额外的治疗和驱散能力。
对于追求更高生存能力的玩家，可考虑组建治疗型水主阵容，以纲手或静音作为辅助核心，搭配高输出忍者如漩涡鸣人或宇智波佐助。这种阵容通过强化治疗和增益效果，保证队伍的持续作战能力，在面对高爆发阵容时表现稳定。水主阵容在面对免疫不良状态或具备强力驱散能力的对手时会受到一定限制。水主在PVP和PVE中的表现差异明显，竞技场中推荐使用水毒牙搭配伊鲁卡或勘九郎，利用先手优势快速建立毒素层数；而在副本挑战中，则更适合采用均衡型阵容，兼顾输出与生存。
