幻之试炼的核心机制围绕随机性与成长体系展开。玩家每次挑战会进入由不同格子组成的地图，包括遭遇战、商店、神秘事件等随机房间。击败敌人后可从多个增益选项中强化角色，例如秘卷伤害提升、技能冷却缩减或普攻回血等。每天击败3名首领可领取金币奖励，而完全通关后还能获得专属称号。在路线选择上，建议优先进入减少技能冷却或强化秘卷的关卡，这类增益对后期战斗影响显著。
流派选择是通关的关键。目前主流玩法包括秘卷流、技能流和奥义流。秘卷流依赖一字连柱或土流枪等范围型秘卷，搭配秘卷强化秘卷连发等增益，可远距离安全输出。技能流则需要集中强化特定技能，例如用木叶丸的扫把普攻配合二技能远程消耗，或奇拉比的连招循环。奥义流则需叠加奥义伤害与能量回复，适合拥有高爆发奥义的忍者。无论选择哪种流派，前两关的增益搭配至关重要，若未成型建议重开以节省时间。
实战中需注意三点技巧。BOSS战需针对性策略：前两关优先选择单体BOSS如矢仓，利用秘卷破霸体后连招压制；第四关后BOSS开场自带霸体，需先用秘卷打断再输出。合理利用环境机制，例如通过幻境扭曲跳转路线避开高难度关卡，或触发神秘房间获取额外宝箱。保持血量健康，战斗中可优先选择普攻回血、技能吸血等增益，部分关卡达成无伤或高血量通关会触发隐藏光门，提供稀有强化。
隐藏内容与成就系统为玩法增添深度。击败特定BOSS后可能触发隐藏关卡，例如须佐能乎佐助或秽土斑，这类战斗难度极高但奖励丰厚。完成使用木叶丸通关或无伤通过三关等成就可解锁柱间等特殊角色，需针对性规划路线与增益。对于追求极限的玩家，无尽模式提供无限关卡挑战，排名数据将永久记录在幻之石碑上，成为荣誉象征。
